Au même titre que la flore, la faune de la réserve est particulièrement diversifiée du fait de l’hétérogénéité des habitats présents. On retrouve notamment des cortèges de faune caractéristiques des bocages anciens et conservés ainsi que de nombreuses espèces des zones humides. En quelques années, plus de 1500 taxons ont déjà été inventoriés dans seulement 13 groupes étudiés : 41 mammifères dont 16 chauves-souris, 136 oiseaux dont 57 nicheurs, 5 reptiles (squamates), 10 amphibiens, 55 papillons de jour (rhopalocères), 399 papillons de nuit (hétérocères), 41 odonates, 40 orthoptères, > 500 coléoptères, 189 araignées, 24 fourmis, 24 punaises et 6 poissons. Cette liste, loin d’être exhaustive, est complétée chaque année par de nouvelles découvertes. Liste mise à jour au 20/07/2022.